Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hps4Q99KG7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms