Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Apobec3Q99J72 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apobec3Q99J72 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Apobec3Q99J72 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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