Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms