Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Smim11aQ99J19 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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