Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctu1Q99J10 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctu1Q99J10 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctu1Q99J10 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctu1Q99J10 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctu1Q99J10 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctu1Q99J10 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctu1Q99J10 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms