Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Slc8b1Q925Q3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms