Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Usp3Q91W36 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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