Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ttc8Q8VD72 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc8Q8VD72 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc8Q8VD72 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc8Q8VD72 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ttc8Q8VD72 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc8Q8VD72 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc8Q8VD72 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc8Q8VD72 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc8Q8VD72 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc8Q8VD72 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc8Q8VD72 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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