Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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