Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmx1Q8VBT0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmx1Q8VBT0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms