Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gtf3c5Q8R2T8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gtf3c5Q8R2T8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gtf3c5Q8R2T8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gtf3c5Q8R2T8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gtf3c5Q8R2T8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gtf3c5Q8R2T8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gtf3c5Q8R2T8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gtf3c5Q8R2T8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gtf3c5Q8R2T8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gtf3c5Q8R2T8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gtf3c5Q8R2T8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gtf3c5Q8R2T8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gtf3c5Q8R2T8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c5Q8R2T8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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