Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim29Q8R2Q0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms