Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf183Q8QZS5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms