Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms