Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

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Length 718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Spire2Q8K1S6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Spire2Q8K1S6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Spire2Q8K1S6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Spire2Q8K1S6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Spire2Q8K1S6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Spire2Q8K1S6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire2Q8K1S6 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms