Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
FgbQ8K0E8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms