Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lrit1Q8K099 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrit1Q8K099 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms