Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc4a8Q8JZR6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc4a8Q8JZR6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms