Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms