Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rbm28Q8CGC6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rbm28Q8CGC6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rbm28Q8CGC6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbm28Q8CGC6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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