Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cdkl1Q8CEQ0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms