Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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