Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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