Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Atg4aQ8C9S8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg4aQ8C9S8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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