Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129 ms