Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYH8

Chd9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 2,885 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd9Q8BYH8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd9Q8BYH8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd9Q8BYH8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd9Q8BYH8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd9Q8BYH8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd9Q8BYH8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd9Q8BYH8 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd9Q8BYH8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd9Q8BYH8 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd9Q8BYH8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd9Q8BYH8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd9Q8BYH8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd9Q8BYH8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd9Q8BYH8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd9Q8BYH8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd9Q8BYH8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd9Q8BYH8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Chd9Q8BYH8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Chd9Q8BYH8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms