Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx17Q8BVL3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms