Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NfascQ810U3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms