Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChfrQ810L3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms