Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms