Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ubfd1Q78JW9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ubfd1Q78JW9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ubfd1Q78JW9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ubfd1Q78JW9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ubfd1Q78JW9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ubfd1Q78JW9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ubfd1Q78JW9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Ubfd1Q78JW9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ubfd1Q78JW9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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