Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms