Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trpv1Q704Y3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trpv1Q704Y3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trpv1Q704Y3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trpv1Q704Y3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trpv1Q704Y3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trpv1Q704Y3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trpv1Q704Y3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trpv1Q704Y3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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