Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Topbp1Q6ZQF0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms