Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

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Length 1,607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Thsd7bQ6P4U0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Thsd7bQ6P4U0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Thsd7bQ6P4U0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Thsd7bQ6P4U0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Thsd7bQ6P4U0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Thsd7bQ6P4U0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thsd7bQ6P4U0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms