Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Smarca2Q6DIC0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms