Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cntn4Q69Z26 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cntn4Q69Z26 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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