Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Pkp4Q68FH0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pkp4Q68FH0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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