Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Atg9aQ68FE2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Atg9aQ68FE2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Atg9aQ68FE2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Atg9aQ68FE2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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