Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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SrmQ64674 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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SrmQ64674 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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SrmQ64674 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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SrmQ64674 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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SrmQ64674 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrmQ64674 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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