Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a5Q63ZW6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms