Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms