Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ift52Q62559 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ift52Q62559 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ift52Q62559 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ift52Q62559 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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