Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms