Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sin3bQ62141 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms