Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cln3Q61124 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln3Q61124 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln3Q61124 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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