Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbbp4Q60972 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms