Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atf3Q60765 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms