Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myh1Q5SX40 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myh1Q5SX40 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms