Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mdh1bQ5F204 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mdh1bQ5F204 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mdh1bQ5F204 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mdh1bQ5F204 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mdh1bQ5F204 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mdh1bQ5F204 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mdh1bQ5F204 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Mdh1bQ5F204 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Mdh1bQ5F204 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Mdh1bQ5F204 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdh1bQ5F204 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdh1bQ5F204 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdh1bQ5F204 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdh1bQ5F204 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdh1bQ5F204 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdh1bQ5F204 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdh1bQ5F204 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdh1bQ5F204 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdh1bQ5F204 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdh1bQ5F204 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdh1bQ5F204 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Mdh1bQ5F204 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdh1bQ5F204 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdh1bQ5F204 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Mdh1bQ5F204 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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